LEHU乐虎

    RNC联合 circRNA芯片

    • 简介
    • 技术优势
    • 实验原理和流程
    • 结果展示


    • CircRNA是一类由特殊剪接机制形成的、具有闭合环状结构的非编码RNA。circRNA分子的组织特异性、疾病特异性、时序特异性及高稳定性等特征，使得circRNA在临床研究中具有明显的优势。


      RNC（新生核糖体肽链复合物）分离是一种分离核糖体-RNA复合物的方法，由于RNA主要在翻译阶段与核糖体结合，因此根据核糖体-RNA复合物特有的沉降系数，顺利获得离心的方法对其进行分离之后，便可以取得正在翻译的RNA信息。


      顺利获得RNC分离联合LEHU乐虎RNA芯片可以准确鉴定具有翻译潜力的circRNA。circRNA翻译多肽与胃癌、结肠癌以及肌肉生成等多种疾病与生理过程的发生开展密切相关。


      Molecular Cell：circRNA顺利获得“显性负效应”调控母基因功能

      ncRNA领域开拓者，美国医学科研院院士，斯坦福大学医学院著名教授Howard Y. Chang在《Molecular Cell》上发表重磅文章，揭示了circRNA翻译多肽, 顺利获得“显性负效应”（dominant-negative effect）拮抗母基因功能的新机制。即circFGFR1翻译产生的多肽circFGFR1p导致FGFR1的功能受到抑制的现象。


      图1. circFGFR1翻译产生的多肽circFGFR1p顺利获得“显性负效应”抑制FGFR1的功能



    • 1、取样方式简单便捷，细胞量可低至2*10^6；

      2、高灵敏度检测与核糖体结合的circRNA分子：能准确鉴定与核糖体结合的circRNA，且不受开放阅读框长度和核糖体结合位点的影响；

      3、保真性高的检测结果：直接离心特异性分离RNC组分，不易引入其他污染；

      丰富的注释信息及SCI文章发表级别的图谱

    • RNC（Ribosome-nascent chain）分离联合LEHU乐虎RNA芯片服务顺利获得细胞裂解后离心的方法，特异性分离出RNC组分，抽提RNA后取得与核糖体结合的具有翻译潜力的RNA分子。再经过高灵敏度性的LEHU乐虎RNA表达芯片，特异性检测与核糖体结合circRNA的情况，准确筛选出具有翻译潜力的circRNA信息。

    • circRNA_ID

      Alias

      test

      control

      Fold change

      test( % Enrichment)

      control( % Enrichment)

      Diff % Enrichment

      hsa_circRNA_002448

      hsa_circ_0002448

      -0.23669566

      -0.93537523

      1.62301864

      47%

      26%

      21%

      hsa_circRNA_402481


      1.632452577

      -0.33156857

      3.901479032

      79%

      23%

      56%


      1、RNC结合circRNA的差异信息表格


      chrom

      strand

       txStart

      txEnd

      circRNA_type

      best_transcript

      GeneSymbol

      chr1

      -

      11133990

      11137005

      exonic

      NM_001001998

      EXOSC10

      chr2

      -

      224629929

      224642586

      exonic

      NR_110905

      AP1S3


      2、RNC结合circRNA的差异信息聚类图



      3、深入数据分析：RNC结合circRNA的母基因mRNA GO/KEGG分析


      参考文献：
      [1] Tahmasebi S et. al. Nat Rev Mol Cell Biol. 2018. PMID: 30038383.